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Genes Dev:美科学家绘制全基因组DNA修复图谱

2015-05-07 佚名 生物谷

利用化疗药物cisplatin或oxaliplatin杀伤癌细胞,会造成DNA损伤,因此癌细胞就不能够进行正常的DNA复制。但癌细胞仍然有各种方式进行DNA损伤修复,这直接导致癌症化疗药物不能高效发挥作用,满足病人需求。   近日,来自美国的科学家开发出一种方法,能够在全基因组范围内精确定位DNA损伤修复位点。这一研究进展发表在国际学术期刊Genes & Developm

利用化疗药物cisplatin或oxaliplatin杀伤癌细胞,会造成DNA损伤,因此癌细胞就不能够进行正常的DNA复制。但癌细胞仍然有各种方式进行DNA损伤修复,这直接导致癌症化疗药物不能高效发挥作用,满足病人需求。
 
近日,来自美国的科学家开发出一种方法,能够在全基因组范围内精确定位DNA损伤修复位点。这一研究进展发表在国际学术期刊Genes & Development。这项新方法或对提高肿瘤治疗效率,解决癌细胞耐药性问题具有重要意义。

(点击可放大)

文章作者sancer这样说道:“现在我们可以跟同行科学家们说‘只需告诉我们你感兴趣的基因,我们就能告诉你它是如何修复的’,在六十亿个碱基对挑出一个你感兴趣的位点,我们也能告诉你它是如何发生修复的。”
 
在该项研究中,研究人员利用人类皮肤细胞进行了一系列实验,他们对细胞进行UV处理,造成DNA损伤,利用TFIIH抗体对DNA修复复合物以及DNA损伤片段进行分离,随后对分离的DNA片段进行测序以及生物信息学分析,在全基因组范围内找到DNA损伤修复的精确位置,从而首次绘制出全基因组范围内的DNA损伤修复图谱。
 
目前,研究人员正在利用这一方法对化疗药物cisplatin造成的DNA损伤细胞的DNA修复位点进行相关研究,同时,他们期望能够在动物模型上找到癌细胞进行DNA损伤修复维持存活的特定机制。
 
最后,研究人员指出,目前cisplatin主要与一些药物联合使用起到杀伤该细胞的作用,这些药物可以增强癌细胞对cisplatin的敏感性,但其中的机制仍然不清楚。利用该研究中使用的方法可以找到癌细胞发生DNA损伤修复的精确位置,他们期望通过对癌细胞DNA损伤修复机制的研究找到增强癌细胞对化疗药物敏感性的方法,帮助癌症病人战胜癌症。

原始出处:


Hu J1, Adar S2, Selby CP1, Lieb JD3, Sancar A4.Genome-wide analysis of human global and transcription-coupled excision repair of UV damage at single-nucleotide resolution.Genes Dev. 2015 May 1;29(9):948-60. doi: 10.1101/gad.261271.115.


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