Vaccine：新技术评估狂犬疫苗菌株类别及稳定性
2015-09-25 sunshine 译 MedSci原创
Vaccine :使用全基因组种群数据可准确评估疫苗菌株的类别及稳定性——第二代疫苗质量控制疫苗是最有效的公共健康预防措施，在疫苗的帮助下，可防止传染病的蔓延，联合其他措施共同应用时甚至可根除某些传染病。到目前为止，疫苗的许可以及质量控制需要测定疫苗中具有复制能力的感染原的同源基因组序列。最近改善过的测序技术可测定全基因组并可做种群遗传分析，可靠性以及分辨率都很高。种群遗传分析对于RNA病毒来说尤
疫苗是最有效的公共健康预防措施，在疫苗的帮助下，可防止传染病的蔓延，联合其他措施共同应用时甚至可根除某些传染病。到目前为止，疫苗的许可以及质量控制需要测定疫苗中具有复制能力的感染原的同源基因组序列。最近改善过的测序技术可测定全基因组并可做种群遗传分析，可靠性以及分辨率都很高。种群遗传分析对于RNA病毒来说尤其重要，包括异质种群波动而非遗传稳定性。关于此方面的信息已整合至现有的管理框架之中，对疫苗许可当局以及疫苗生产商提出了新的挑战，以促其制定新的质量控制标准。
对商品化的已改良的口服狂犬疫苗及其前体菌株进行了深测序，以评估菌株的类型并基于种群多样性评估不同菌株之间的关系。基于曼哈顿距离计算出病毒种群的成分推断出菌株之间的关系。
通过对病毒种群整体的遗传多样性进行深测序并加以分析，该研究提供了一种可评估病毒菌株关系的新方法，且具有较高的分辨率及稳定性。将该研究中基于种群推断菌株关系的新方法与传统的同源序列分析相比后，可明显发现同源序列分析或可产生误导。因此，在病毒疫苗的质量控制方面，深测序分析优于同源序列分析。
总而言之，该研究所提出的方法允许在疫苗的质量控制及许可中常规整合深测序数据以高度可靠的评估菌株的类别及稳定性。
原始出处：
Höper D, Freuling C et al. High definition viral vaccine strain identity and stability testing using full-genome population data - The next generation of vaccine quality control. Vaccine. 2015 Sep 17.
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