J Periodontal Res：唾液转录组作为确定疾病易感性的新型生物标志物的可行性
2017-12-31 MedSci MedSci原创
唾液转录组可以作为潜在的生物标志物的容易获得的和非侵入性的来源呈现。慢性牙周炎的发展由个体患者的易感性决定;因此，本研究的目的是确定使用慢性牙周炎作为疾病易感性生物标志物的唾液转录组的可能性。使用Oragene®RNA试剂盒，从10名慢性牙周炎患者和10名没有慢性牙周炎患者的唾液中纯化总RNA。测定总RNA的数量和质量，并使用Affymetrix微阵列系统通过cDNA进行基因表达的测量。通过实时定
唾液转录组可以作为潜在的生物标志物的容易获得的和非侵入性的来源呈现。慢性牙周炎的发展由个体患者的易感性决定;因此，本研究的目的是确定使用慢性牙周炎作为疾病易感性生物标志物的唾液转录组的可能性。
使用Oragene®RNA试剂盒，从10名慢性牙周炎患者和10名没有慢性牙周炎患者的唾液中纯化总RNA。测定总RNA的数量和质量，并使用Affymetrix微阵列系统通过cDNA进行基因表达的测量。通过实时定量聚合酶链式反应进一步验证微阵列分析结果。
分光光度分析显示从每个参与者纯化的总RNA范围从0.92微克/ 500微升至62.85微克/ 500微升。本研究中2组总RNA的变异性较大，牙周炎组为10.21±12.71μg/500μL，对照组为15.97±23.47μg/500μL。此外，大多数参与者（9名牙周炎和6名对照）的RNA纯度（基于A260 / A280比率）在下游分析的可接受范围内（2.0±0.1）。该研究样品在细菌rRNA的23S（3800bp）和16S（1500bp）特征处显示2条明显的条带。对4个样品（P2，P6，H5和H9）进行初步微阵列分析。 4个样品中存在的基因百分比与检测到的基因的约1.8％-18.7％不一致。定量实时聚合酶链反应证实，从每个样品纯化的总RNA主要是具有最小的人mRNA的细菌RNA（Uni 16S）。
这项研究表明，从牙周炎患者的唾液以及对照中能够分离到最少量的人类RNA。如果将唾液转录组用于确定个体患者易感性，则需要进一步的工作来增强从唾液中提取人mRNA的过程。
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