【衡道丨笔记】常规技术对分子病理检测与诊断的影响
2024-03-24 衡道病理 衡道病理 发表于上海
“复旦大学附属中山医院病理科32周年系列公开课”的课程中,宿杰阿克苏老师为大家带来了常规技术对分子病理检测与诊断的影响的内容。摘要如下:
内容摘要
一、病理检查流程
二、固定及取材影响因素
固定目的
1.保持离体组织细胞的形态;
2.细胞内特殊物质定位;
3.保持细胞内抗原、DNA及RNA;
4.硬化组织有利于切片;
5.便于对细胞内不同成分区别。
影响因素
固定:
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标本离体是否在一个时间点及时固定;
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固定剂的重要特征——可使蜡块的HE染色保持高质量和一致性,无论在初始还是在保存10年后;
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固定的方法;
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固定的时间与标本的大小。
取材:
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组织取材厚度及大小;
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小标本取材用相应材料包裹;
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脱水盒中组织放置方向;
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去除组织内杂物;
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骨组织及钙化组织脱钙;
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脱钙标本脱钙时间或流水冲洗时间;
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标本是否干涸。
三、组织处理影响因素
全自动脱水机注意事项
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选择程序;
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开机前检查试剂液面;
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开机前擦拭探头;
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脱水篮放置平稳;
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不可擅自更改脱水程序;
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发生问题时判断原因,不能随意处理;
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运行机器时不能误操作;
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使用试剂及时更换;
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更换试剂时位置更换准确;
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更换试剂后设置全部试剂状态;
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在开机前对机器做简单维护;
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开机后再检查机器运行状态。
四、包埋流程影响因素
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包埋前应清理台面上残留组织碎屑;
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使用的包埋模具应清洁;
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准确判断包埋面;
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按要求进行包埋;
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发现问题及时和取材医师沟通反馈。
五、石蜡切片流程影响因素
毛笔:洁净、无蜡屑、无异物;
弯镊:洁净、无蜡屑、无异物,必要时使用无水乙醇擦拭;
一次性刀片:锋利、无缺口;
载玻片:洁净、无油腻、无水渍及污物;
载玻片打号机:用于打印相应蜡块的病理编号于载玻片上;
轮转式切片机:人工、半自动或全自动;
冷冻台:用于切片前的蜡块冷却,使蜡块维持一定的切片硬度;
漂片仪/水浴锅:用于蜡片的漂片展平;
烤片机/烤箱:用于切片的烘烤和沥水。
六、分子病理检测切片影响因素
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及时登记(蜡块、申请单)、及时归档(蜡块、HE等);
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及时清洁切片台面;
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准备干净的载玻片;
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切片工具的清洁;
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脱蜡试剂要定期更换;
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每天一次清洗水浴锅;
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切每个标本更换刀片,用75%酒精进行刀架消毒,防止污染;
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写片时,要写全关联医嘱的病理号,包括年份和蜡块小号,肿瘤区域富集细胞等,方便后续切片评估和核对蜡块;
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有问题及时与诊断医生沟通(指标,小号与免疫组化不一致)。
七、HE染色影响因素
烤片:烤片时间需充分,防止在染色过程中发生脱片;
脱蜡:脱蜡要彻底,防止染色时切片不易着色;
胞核染色:①苏木素染核 ②盐酸酒精分化 ③蓝化.;
胞浆染色:伊红染胞浆;
脱水:梯度酒精脱水;
透明:透明要彻底。
八、分子病理检测三大主流技术
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FISH
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测序技术:Sanger测序、NGS
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PCR:qPCR/RT-qPCR、ARMS、ddPCR
FISH操作影响因素
组织固定不充分,FISH预处理时组织脱落,镜下可见细胞呈“棉絮状”或“软团块状”。组织固定过度,可能导致样本蛋白等大分子物过度交联,镜下“细胞核可见空洞、DAPI过分均质”
二者都可能出现信号减弱或无信号。
切片太薄(实际厚度<3μm),容易消化过,具信号出现很大比例的丢失,影响结果判读;
切片太厚(实际厚度>5μm),难于消化,容易出现高背景,信号层面增多影响观察判读。
脱蜡不足:后续实验步骤都无法补教,导败背景高甚至探针杂交失败。脱蜡使用的二甲苯需经常更换,并可根据实际情况延长脱蜡时间。
石蜡样本基因提取要点总结
1、样本评估、优化流程:
选取瘤细胞丰富,无坏死、粘液、软骨区域。
珍惜穿刺小标本,HE切片同时或初诊后及时留取组织蜡片优先保证分子检测。
2、严格消毒、蜡片量适当:
单人单刀口,75%酒精彻底消毒刀架、镊子等。操作者带口罩、手套。
5μm厚蜡片大块组织2-4张,小组织5-8片。组织量不宜过多。
3、脱蜡彻底、酶解完全
二甲苯脱蜡3次,13000x3min/次
蛋白酶K裂解完全(56℃),胶原等组织少量残余不影响后续检测,推荐水浴,可过夜,酶解时间长可获得更长的片段。
4、根据样本调整洗脱液量
通过调整DNA洗脱液量间接调节DNA浓度(小标本)
PCR上样时,直接用脱液稀释模板>100ng/μl,倍比稀释。
注:低盐高pH洗脱
ARMS结果判定注意点
九、总结
常规技术流程繁琐、制作过程需要操作精细,每一步操作都可能影响到后续的质量;是做出准确病理诊断的关键。
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