ASCO2017:从临床组织和液体活检样本中发现了前列腺癌的BRCA1/2基因回复突变
2017-06-06 MedSci MedSci原创
在BRCA1或BRCA2(BRCA)中带有基因组改变(GA)的前列腺肿瘤可能对PARP抑制剂(PARPi)的治疗很敏感。然而，继发性回复突变(revGA)可能会恢复BRCA基因的功能，并降低对PARP抑制剂(PARPi)的治疗或基于白金(Pt)疗法的治疗的敏感性。使用组织或液体活组织检查进行全面的基因组分析(CGP)，可以检测出临床相关的revGA的多样性。
在BRCA1或BRCA2(BRCA)中带有基因组改变(GA)的前列腺肿瘤可能对PARP抑制剂(PARPi)的治疗很敏感。然而，继发性回复突变(revGA)可能会恢复BRCA基因的功能，并降低对PARP抑制剂(PARPi)的治疗或基于白金(Pt)疗法的治疗的敏感性。使用组织或液体活组织检查进行全面的基因组分析(CGP)，可以检测出临床相关的revGA的多样性。
对1911名主要复发、难治性或转移性前列腺癌患者进行常规临床治疗时，从石蜡包埋（FFPE）肿瘤组织或血液样本中提取DNA，并采用杂交捕获（HC）实验和新一代测序技术对所有类型的基因组改变(GA)进行分析，包括碱基替换、插入和缺失、重组和拷贝数变化。
如果在基因序列中有一个无意义的或移码突变(fs)的基因改变(GA)，回复突变(revGA)可以使任何一种基因组改变(GA)恢复阅读框架。
研究结果显示:216/1911(11.3%)前列腺癌肿瘤患者至少有1个有害的BRCA基因组改变(GA)。其中，7个样本在BRCA1(1)或BRCA2(6)中有潜在的revGA：前列腺腺泡状腺癌(5)，神经内分泌癌(1)，或未分化的癌(1)；其中2个样本是液体活组织检查(血液)，4个是石蜡包埋（FFPE）组织样本(肝脏)，1个样本是骨髓芯活检。所有带有revGA的样本都是转移性肿瘤。潜在的revGA有3种类型：重叠插入缺失(4)，补偿性的移码突变(fs)(2)和错义(1)。有个样本有两种revGA：一个重叠插入缺失和一个补偿性的移码突变。TMPRSS2(融合基因)、PTEN基因和AR的改变频率与BRCA基因突变相似或者不相似；revga-阳性样本在PTEN基因变化方面有轻微的增加(42.9%vs.33.8%，无显着性差异(NS))。在BRCA基因突变型的肿瘤中，CDK12改变的频率显着降低(0.9%vs .6.9%，p=0.00002)。患者的回复突变的临床病史将会出现。
1911名前列腺癌患者的基因组分析(CGP)显示，11.3%的患者至少有1个有害的BRCA1/2基因。从这些病例中，我们发现了7个样本在BRCA1(1)或BRCA2(6)中有潜在的回复突变（revGA）：前列腺腺泡状腺癌(5)，神经内分泌癌(1)，或未分化的癌(1)。尽管很少，但说明回复突变（revGA）可以在治疗过程中获得，并且可能是对PARP抑制剂(PARPi)的治疗或基于白金(Pt)疗法的治疗的抵抗。而且，BRCA基因回复突变（ revGA）可以从组织和液体活检中检测出来。
原始出处：
Sugganth Daniel， Erica Gornstein， Garrett Michael Frampton，et al. BRCA1/2 reversion mutations in prostate cancer identified from clinical tissue and liquid biopsy samples. 2017 ASCO Annual Meeting. June 2017.
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