回归可视化---列线图(nomogram)画法(附R源代码)
2016-06-20 Yuan LX 统计咨询
Nomogram就是这样一种有效的工具,中文常称为诺莫图或者列线图,其实质就是回归方程的可视化。它根据所有自变量回归系数的大小来制定评分标准,给每个自变量的每种取值水平一个评分,对每个患者,就可计算得到一个总分,再通过得分与结局发生概率之间的转换函数来计算每个患者的结局时间发生的概率。图1就是一个关于COX回归的nomogram,图中points就是一个选定的评分标准或者尺度,对于每个自变量取
Nomogram就是这样一种有效的工具,中文常称为诺莫图或者列线图,其实质就是回归方程的可视化。它根据所有自变量回归系数的大小来制定评分标准,给每个自变量的每种取值水平一个评分,对每个患者,就可计算得到一个总分,再通过得分与结局发生概率之间的转换函数来计算每个患者的结局时间发生的概率。图1就是一个关于COX回归的nomogram,图中points就是一个选定的评分标准或者尺度,对于每个自变量取值,在该点做一条垂直于Points轴的直线(可通过直尺),交点即代表该自变量取值下的评分,如CEA,取0时评分为0分,CEA为20时评分约为12.5分。以此类推,计算每个患者各个自变量对应的分值points,加起来就是总分total points。同样的道理,在Total Points轴上找到该患者总分对应的点,画一垂直直接到生存概率轴上(如3年生存概率3-year Survival或者5年生存概率 5-year Survival),交点即为该患者的3年或5年生存概率。该方法只要给予简单的说明就可以轻松的掌握使用方法。 图1 nomogram示意图 空白图1来源于JCO的一篇文献。下面就随我一起来
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