Neurology：PARK10进一步被证实是散发性帕金森病的主要基因位点
2015-02-19 lizhixing译 MedSci原创
有关帕金森病（PD）遗传学研究，其病理学诊断存在的差异较大。为了将差异最小化，活检-诊断帕金森病遗传学联合会针对神经病理诊断的PD病人及对照人群进行了全基因关联研究。研究方法：对符合神经病理学诊断标准的484例病例和1145例对照进行了基因分型，然后对大约3922209个位点进行全基因关联研究。研究结果：1号染色体上一小区域和PD有强相关性(rs10788972; p = 6.2 × 10−8)。
PARK10 区域的Manhattan图
研究方法：
对符合神经病理学诊断标准的484例病例和1145例对照进行了基因分型，然后对大约3922209个位点进行全基因关联研究。
研究结果：
1号染色体上一小区域和PD有强相关性(rs10788972; p = 6.2 × 10−8)。其关联性峰值位于且非常接近于最大连锁性峰值，该峰值由之前定义PARK10的2个正性连锁分析获得。我们得出，rs10788972和rs914722存在强的连锁不平衡性，作为定义 PARK10单体型的单核苷酸多样性，rs914722和PD发病年龄存在强相关性。而且，我们将包含PARK10位点在内的区域长度从10.6mb减少到100kb，并包含4个已知基因：TCEANC2, TMEM59, miR-4781, LDLRAD1。
研究结论：
我们的研究证实了PARK10单体型和散发性PD发病风险有关联。并且明显缩小了PARK10区域的长度。新PARK10区域的候选基因并非都是先前PD生物学涉及到的基因，这就要求未来研究继续寻找新区域。该研究还显示，降低病理学诊断异质性可以强化PD基因关联性研究的应用。
MedSci评论：
PARK10作为PD的可疑基因，最早是2005年通过全基因组分析发现，后来又经过一系列临床结果证实。此次研究将PARK10区域进一步缩小，聚焦于四个关键基因：TCEANC2, TMEM59, miR-4781, LDLRAD1，也意味着PD可以基本锁定在这几个基因上，下一步，需要采用更大规模的临床样本，进一小验证这四个基因中，哪一个更为重要。这一点，希望我们中国研究者能率先进行研究。一旦最终靶标确定，未来它可以作为诊断和治疗的重要靶点。
原始出处：
Beecham GW, Dickson DW, Scott WK, Martin ER, Schellenberg G, Nuytemans K, Larson EB, Buxbaum JD, Trojanowski JQ, Van Deerlin VM, Hurtig HI, Mash DC, Beach TG, Troncoso JC, Pletnikova O, Frosch MP, Ghetti B, Foroud TM, Honig LS, Marder K, Vonsattel JP, Goldman SM, Vinters HV, Ross OA, Wszolek ZK, Wang L, Dykxhoorn DM, Pericak-Vance MA, Montine TJ, Leverenz JB, Dawson TM, Vance JM.PARK10 is a major locus for sporadic neuropathologically confirmed Parkinson disease. Neurology. 2015 Feb 6. pii: 10.1212/WNL.0000000000001332.
Maraganore DM, de Andrade M, Lesnick TG, Strain KJ, Farrer MJ, Rocca WA, Pant PV, Frazer KA, Cox DR, Ballinger DG.High-resolution whole-genome association study of Parkinson disease. Am J Hum Genet. 2005 Nov;77(5):685-93.
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