BMC Cancer：膀胱癌免疫微环境相关基因分析，可用于预测患者的预后
2020-05-26 MedSci原创 MedSci原创
浸润性免疫细胞和基质细胞是膀胱癌（BC）微环境的重要组成部分，可显著影响BC的进展和结果。然而，肿瘤浸润免疫细胞的每个亚组的贡献尚不清楚。本研究旨在对肿瘤免疫微环境进行细胞表型和转录分析，分析不同细胞
浸润性免疫细胞和基质细胞是膀胱癌（BC）微环境的重要组成部分，可显著影响BC的进展和结果。然而，肿瘤浸润免疫细胞的每个亚组的贡献尚不清楚。本研究旨在对肿瘤免疫微环境进行细胞表型和转录分析，分析不同细胞亚群和基因与BC预后的关联。
从The Cancer Genome Atlas中下载了412例BC患者的临床数据和433个正常和癌症组织的转录文件。采用CIBERSORT算法确定每个样本中22种免疫细胞类型的相对丰度，采用ESTIMATE算法确定BC肿瘤微环境中不同表达的基因，并对其进行功能富集和蛋白-蛋白相互作用（PPI）分析。通过Cox回归分析和Kaplan-Meier方法研究了细胞亚群和不同表达基因与患者生存和临床参数的关联。
结果显示，静止的自然杀伤细胞和激活的记忆CD4+和CD8+ T细胞与患者的预后良好相关，而静止的记忆CD4+ T细胞与预后不良相关。差异性表达分析显示，影响免疫和基质细胞评分的基因有1334个；其中97个基因对BC患者的总体生存有预测作用。在PPI网络中前10个有统计学意义的枢纽基因中，CXCL12、FN1、LCK和CXCR4被发现与BC预后相关。
综上所述，该研究结果表明，肿瘤浸润免疫细胞和肿瘤微环境相关基因可影响患者的预后，可能是BC患者预后和免疫治疗反应的重要决定因素。
原始出处：
Ye Zhang, De-Hua Ou, et al., In Silico Analysis of the Immune Microenvironment in Bladder Cancer. BMC Cancer. 2020 Mar 30;20(1):265. doi: 10.1186/s12885-020-06740-5.
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膀胱癌真怪，明明是免疫敏感性肿瘤，为什么PD-1治疗效果不好呢？难道靶点不对？将来CD47会不会有效
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