JCO:表观遗传学的改变可对AML患者预后产生影响
2014-01-09 佚名 丁香园
急性髓系细胞白血病(AML)的分子危险分层主要依赖遗传标记物。然而,表观遗传学的改变(包括:DNA甲基化,基因表达失调)可能会对患者的预后产生影响。为此,来自俄亥俄州立大学的研究人员评估了整合DNA甲基化和基因相关信息对AML患者临床预后是否有关系。该研究发表于2013年12月30日在线出版的《临床肿瘤学杂志》(Journal of Clinical Oncology)上。
急性髓系细胞白血病(AML)的分子危险分层主要依赖遗传标记物。然而,表观遗传学的改变(包括:DNA甲基化,基因表达失调)可能会对患者的预后产生影响。为此,来自俄亥俄州立大学的研究人员评估了整合DNA甲基化和基因相关信息对AML患者临床预后是否有关系。该研究发表于2013年12月30日在线出版的《临床肿瘤学杂志》(Journal of Clinical Oncology)上。【原文下载】
利用二代测序技术研究人员检测了AML患者的DNA甲基化水平并鉴定差异性甲基化区域(DMRs)对细胞遗传学正常的老年AML患者(>60岁)预后的影响,该研究共纳入134例患者。和预后显著相关的启动子DMRs基因以及表达水平被用于预后基因的加权汇总表达评分,该研究分为4个独立的实验组,共纳入355例患者。
研究人员在训练集检测了7种基因(CD34,RHOC,SCRN1,F2RL1, FAM92A1,MIR155HG和VWA8)发现,启动子DMRs和基因表达和总生存期(OS)相关。研究人员对7种基因进行加权汇总表达评分发现,评分较低和无疾病生存期、总生存期延长相关。该结果已经在多变量模型和其他实验组中得到验证。单独考虑7种基因,越高表达的基因预后越好。年轻和老年患者没有基因表达或者只有一种基因高表达预后最好。
检测AML患者表观遗传学的改变和预后相关基因信息对临床治疗具有重要的指导意义。
研究背景
大多数成年AML患者用现在的治疗方案不能治愈,只有约40%的年轻患者和10%的老年患者能够达到长期生存。因此,目前的迫切任务是寻找更有效改善患者预后的治疗方案并确定新的治疗靶点。为了实现这一目标,研究人员近期把重点放在和临床预后有关的分子标志物上。并且,把它们运用到患者的危险分层和临床指导上。迄今为止,AML的疾病分类和预后在很大程度上依赖细胞遗传学和基因检测,而像表观遗传学改变等因素没有纳入其中。
表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达了可遗传的变化。异常的DNA甲基化是最能体现白血病的表观遗传学变化,有可能是白血病的治疗靶点。然而,现有的关于AML异常DNA甲基化的研究大部分只是研究几个基因的改变,很少分析全基因组DNA甲基化的变化。仅仅依靠DNA甲基化来判断预后的研究已经有报道,但整合遗传学和表观遗传学的信息对AML患者预后和治疗效果进行预测的研究尚未报道。
原文出处:
Marcucci G, Yan P, Maharry K, Frankhouser D, Nicolet D, Metzeler KH, Kohlschmidt J, Mrózek K, Wu YZ, Bucci D, Curfman JP, Whitman SP, Eisfeld AK, Mendler JH, Schwind S, Becker H, Bär C, Carroll AJ, Baer MR, Wetzler M, Carter TH, Powell BL, Kolitz JE, Byrd JC, Plass C, Garzon R, Caligiuri MA, Stone RM, Volinia S, Bundschuh R, Bloomfield CD.Epigenetics Meets Genetics in Acute Myeloid Leukemia: Clinical Impact of a Novel Seven-Gene Score.J Clin Oncol. 2013 Dec 30. 【原文下载】
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