Sci Rep：新方法帮助降低血液标记物分析误差
2016-08-17 佚名 生物谷
来自瑞典卡罗林斯卡研究所的研究人员最近开发了一种帮助提高血液标记物分析精度，减少误差的新方法。相关研究结果发表在国际学术期刊Scientific Reports上。 血液中包含许多细胞类型，为生物学和临床研究提供了许多生物标记物。血液作为一种液体活检样本，由于取样简单，动态变化快速，广泛应用在临床研究。但是血液中大部分细胞都是携带氧气的红细胞，导致所有血液RNA中富集了高达50%～80%的球
来自瑞典卡罗林斯卡研究所的研究人员最近开发了一种帮助提高血液标记物分析精度，减少误差的新方法。相关研究结果发表在国际学术期刊Scientific Reports上。
血液中包含许多细胞类型，为生物学和临床研究提供了许多生物标记物。血液作为一种液体活检样本，由于取样简单，动态变化快速，广泛应用在临床研究。但是血液中大部分细胞都是携带氧气的红细胞，导致所有血液RNA中富集了高达50%～80%的球蛋白RNA分子。含量丰富的球蛋白使血液相关生物标记物分析变得复杂，引起技术误差，使一些生物学相关分析无法得以检测。
研究人员在这项研究中首次详细描述一种叫做GlobinLockTM的新方法，该方法可以克服因红细胞造成的血液样本分析局限。该方法将血液标记物分析中对试剂和样本的需求最小化，使其成为一个更有效更强力的工具。
这种新方法包含一对短的合成DNA链，通过高度特异性的结合沉默大多数的球蛋白RNA分子。据研究人员介绍在RNA变性之后将合成DNA链引入到纯化的RNA分子中，DNA链可以立即发挥作用，在整个cDNA合成过程中只多出10分钟孵育时间。合成的DNA链可以特异性结合在球蛋白RNA的poly-A位置，这样在血液RNA生物标记物分析应用中球蛋白RNA在进行下面的操作之前就被锁定，不会引起技术误差。
“我们的研究证明锁定球蛋白不仅对人类样品完全有效的，而且可以广泛应用于动物模型，比如小鼠，大鼠，奶牛，狗甚至斑马鱼。”文章作者Juha Kere教授这样表示。
原始出处
Kaarel Krjutškov, Mariann Koel, Anne Mari Roost, Shintaro Katayama, Elisabet Einarsdottir, Eeva-Mari Jouhilahti, Cilla Söderhäll, ülle Jaakma, Mario Plaas, Liselotte Vesterlund, Hannes Lohi, Andres Salumets & Juha Kere.Globin mRNA reduction for whole-blood transcriptome sequencing.Sci Rep.2016
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