Baidu
map

Nature子刊:复旦学者发现血浆蛋白质组图谱可预测个人未来的健康风险

2024-02-01 MedSci原创 MedSci原创 发表于上海

蛋白质组图谱可以替代复杂的实验室测试或临床测量,同时完善多种疾病和死亡的综合风险评估。

开发一种单域检测方法来识别未来事件高风险个体是预防多种疾病和死亡的当务之急。风险分层对于识别高危人群和预防疾病至关重要,尤其是在早期临床前阶段。然而,对人类疾病的全面风险评估往往需要对每种疾病的预测因素进行严格的积累。由于收集信息所需的时间和成本,由此得出的每种疾病的风险评分在临床实际应用中会受到严重限制。因此,能同时预测多种疾病的单域检测方法变得至关重要。目前,许多国家都建议通过血液检测进行常规体检,以预防多种常见疾病,因此,基于蛋白质组学的风险评分有望改善多种疾病的风险预测。

通过训练神经网络,来自我国复旦大学的学者根据 52006 名英国生物库参与者测量的 1461 种 Olink 血浆蛋白,开发出了疾病/死亡特异性蛋白质组风险评分(ProRS)。该综合评分对 45 种常见疾病的风险进行了显著分层,包括传染病、血液病、内分泌疾病、精神疾病、神经系统疾病、感官疾病、循环系统疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病、皮肤疾病、肌肉骨骼疾病、泌尿生殖系统疾病、癌症和死亡率。

结果显示,ProRS 对 10 个终点(如癌症、痴呆和死亡)的判别准确率很高,C 指数超过 0.80。值得注意的是,在几乎所有终点上,ProRS 的预测性能都远远优于或等同于既有的临床指标。将临床预测指标与 ProRS 结合在一起可提高对大多数终点的预测能力,但与单独使用 ProRS 相比,这种组合只显示出有限的改进。一些蛋白质(如 GDF15)对各种疾病具有重要的鉴别价值。此外,研究结果还提示,所观察到的良好鉴别性能在很大程度上可以转化为实际的临床用途。

总而言之,蛋白质组图谱可以替代复杂的实验室测试或临床测量,同时完善多种疾病和死亡的综合风险评估。但是因本模型仅在英国生物库中进行了内部验证;因此,在应用于临床之前,有必要进一步进行独立的外部验证,以确认研究结果的稳定性。

原始出处:

Plasma proteomic profiles predict individual future health risk. Nat Commun. 2023 Nov 28;14(1):7817. doi: 10.1038/s41467-023-43575-7.

版权声明:
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,或“梅斯号”自媒体发布的文章,仅系出于传递更多信息之目的,本站仅负责审核内容合规,其内容不代表本站立场,本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (1)
#插入话题
  1. [GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=2185174, encodeId=f74921851e4f8, content=<a href='/topic/show?id=422241e16cc' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#基因图谱#</a> <a href='/topic/show?id=82aa886807b' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#蛋白组学#</a>, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=78, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[TopicDto(id=41716, encryptionId=422241e16cc, topicName=基因图谱), TopicDto(id=88680, encryptionId=82aa886807b, topicName=蛋白组学)], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=null, createdBy=cade5395722, createdName=梅斯管理员, createdTime=Thu Feb 01 09:38:49 CST 2024, time=2024-02-01, status=1, ipAttribution=上海)]

相关资讯

全面基因组测序:全面解析不同亚型泌尿系统肿瘤基因图谱

泌尿系统肿瘤缺乏有效靶向治疗,免疫治疗初显成效,但有效率有待提高。明确肿瘤的基因组学特征,可以探寻潜在的治疗靶点。在刚刚落幕的ASCO大会上,多项研究采用全面基因组测序(CGP检测)检测泌尿系统肿瘤的基因图谱,探寻可能从靶向或免疫治疗中获益的人群。

Neuron:你快乐吗?大脑中的新“快乐通路”被发现

杏仁核是位于大脑深处的一个很小的部位,它的直径不过略大于1厘米。但是杏仁核在产生和调节人的情绪方面具有关键的作用。通过在动物模型的实验,科学家们一直认为杏仁核的中央部位主要参与大脑中的“恐惧通路”,也就是产生和调节害怕的感觉。但是对于大脑中产生快乐情绪的神经通路一直不为人所知。近日,一项来自美国麻省理工学院(MIT)的最新研究颠覆了这个领域的认知。这项研究发现,中央杏仁核中的大部分神经细胞实际上是

Cell Metab :邵志敏团队为三阴性乳腺癌“复旦分型”精准治疗策略再添新翼

三阴性乳腺癌作为乳腺癌的其中一种亚型,约占总体乳腺癌人群的10-20%,其雌激素受体、孕激素受体以及人表皮生长因子受体2表达均为阴性。这类乳腺癌恶性程度高,容易出现内脏转移,复发风险大,预后较差。

迄今为止很大的精神疾病基因图谱问世

全世界约25%的人口受到某种精神疾病的影响,这些疾病会改变智力、行为、情感和社会关系。人们对精神疾病的关注度越来越高,专家们也对其影响因素进行了调查研究。

Nature:科学家们研究了超5.3万人的基因,揭示疾病遗传密码

一项对5.3万多人的全部基因构成的新分析,为了解心脏、肺、血液和睡眠障碍提供了宝贵的见解,为找到新的、更好的方法来治疗和预防一些最常见的致残和死亡原因铺平了道路。

Cell:超大型基因图谱研究将癌症重新“归类”

美国国家卫生研究院 资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。

Nature Genetics:DeepLoop:利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性染色质互作图谱

研究团队开发了DeepLoop,执行严格的偏差校正,通过基于深度学习的信号增强,从低深度Hi-C数据中实现稳健的染色质相互作用映射。

J Hematol Oncol:肺鳞癌新进展!上海市肺科医院周彩存团队在肺鳞癌免疫和基因图谱研究方面取得新进展!

肺鳞癌是肺癌最常见的组织学类型之一。近年来,PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂的应用为肺鳞癌的治疗带来了新希望,探索有效的疗效预测标志物与合理的免疫联合治疗策略是肺鳞癌治疗领域亟待解决的关键问题。上海市肺科医院周彩存教授团队近期在国际著名肿瘤学期刊Journal of Hematology & Oncology(2018年影响因子:8.731;中科院SCI期刊分区:医学类1区)发表了一项最新研究

香港中文大学率先成功破解鼻咽癌全基因组图谱

香港中文大学(中大)7日公布,其医学院研究人员率先成功破解鼻咽癌全基因组图谱,这是在全球已公布的研究中,首个有系统地进行鼻咽癌全基因组测序分析的研究。

Nature:癌症免疫逃逸基因图谱

在过去的十年中,不同形式的免疫治疗已经成为真正有效的癌症治疗方法,以PD-1/PD-L1抑制剂为代表的癌症免疫疗法彻底改变了癌症领域。然而,免疫治疗只在一部分患者中产生持久反应。

拓展阅读

Cell:癌症治疗的新前沿:基于蛋白组学与基因组学的免疫亚型鉴定与靶向

通过对这些数据的深入分析,作者希望为免疫治疗提供更为精准的靶点,为癌症患者带来更有效的治疗方案。

stroke:靶向血浆蛋白组学结果,这几类蛋白可以准确预测颈动脉斑块的发展

这组新的循环蛋白可被视为临床前动脉粥样硬化发展的标志物

Cell:重磅!中国科学家揭秘肝癌发生发展机制!

2019年10月3日,国际顶尖期刊《cell》(SCI影响因子 36.216)在线发表了复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队、中科院药物所周虎研究员团队、中科院生化与细胞所高大明研究员团队、美国“登月计划”临床蛋白质组肿瘤分析协作组(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium, CPTAC)与至本医疗科技合作的关于中国乙肝病毒阳性的肝细胞癌(HBV-HCC

Nat Commun:前列腺癌整体蛋白组学分析揭示了疾病恶化过程中基因组和转录组的变异

为了理解前列腺癌中基因和转录变异在功能上影响的结果,就需要对在疾病形成和恶化期间蛋白组的变化情况进行阐释。最近,有研究人员对良性前列腺增生(BPH)、未处理的初级前列腺癌(PC)和去势难治性前列腺癌(CRPC)临床组织样本进行了高通量的质谱分析。研究发现,每一个样本群体均表现出了不同的蛋白谱。通过综合的分析,研究人员展示了尤其在CRPC中,基因拷贝数、DNA甲基化和RNA表达水平不能可信的预测蛋白

PNAS:重磅!世界蛋白组癌症早筛平台面世!卵巢癌误检率0!

癌症早筛和早诊是人类预防癌症提高生存率的最有效方式。在这一科研前沿领域,近年来ctDNA、循环肿瘤细胞(CTCs)检测成果显着。然而,传统的肿瘤相关蛋白生物标记物却进展寥寥,近日,一项蛋白组学用于癌症早筛的平台,敲开了“新世界的大门”!

Clin Immunol:利用蛋白组学分析对双边突发性感觉神经性听力损失自身免疫病理证据的鉴定

突发性感觉神经性听力损失(S-SNHL)是一种内耳障碍,并且在3天之内发生突发性的听力损失。然而,到目前为止,该病的病理机制仍旧不清楚,尽管在假设的病因中,自身免疫被认为是其中一个病因,尤其是在双边听力损失中。最近,有研究人员利用蛋白组学方法旨在为自身免疫参与了双边S-SNHL提供证据。研究利用的蛋白组学技术包括了 ProtoArray?、蛋白免疫印迹、免疫沉淀反应和液柱质谱技术等。并且,基于多种

Baidu
map
Baidu
map
Baidu
map