Genes&Diseases:Haiyang Zhou/Caifeng Jiang教授团队揭示血吸虫病相关结直肠癌独特基因特征
2024-04-07 Genes and Diseases Genes and Diseases 发表于陕西省
研究探索了中国SA-CRC病人中的基因组变异以及潜在的发病分子机制。
肠壁中血吸虫卵沉积引起的慢性炎症是血吸虫病相关结直肠癌(SA-CRC)的潜在致病机制。这种癌症在流行病学特征、组织学模式和临床结果等多个方面与散发性结直肠癌(S-CRC)有所区别。
海军军医大学附属长征医院的Haiyang Zhou课题组及苏州大学附属独墅湖医院Caifeng Jiang课题组在本刊发表了题为“Genomic analysis of schistosomiasis-associated colorectal cancer reveals a unique mutational landscape and therapeutic implications”的研究快讯,探索了中国SA-CRC病人中的基因组变异以及潜在的发病分子机制。
1. SA-CRC的基因组特征
作者团队对 30 名SA-CRC 患者进行了深入的基因组分析,在 1978 个基因中共鉴定出 2476个非同义突变(图1A)。SA-CRC 的中位肿瘤突变负荷(TMB)低于S-CRC。大多数 SA-CRC 病例显示出低度微卫星不稳定(MSI-L)或微卫星稳定(MSS)状态。这些结果表明可以将SA-CRC分类为具有低TMB的MSI-L 结直肠癌,SA-CRC患者可能不会从免疫疗法中获益(图1A)。
图1 血吸虫病相关结直肠癌的基因组表达谱
2. 显著突变基因
在30个病人样本中,作者团队鉴定出71个反复突变的基因(图1B)。值得注意的是,作者团队发现了两个新的 de-novo驱动基因:KRT76和PLEKHO1,其缺失都可促进肿瘤生成,揭示了这两个基因在SA-CRC发病机制中可能起到的作用。此外,SA-CRC与其他类型的CRC比较显示出独特的基因变异。例如,PIK3CA、ATM、SMAD4等基因在S-CRC中较为常见,而在SA-CRC中却很少被发现。SA-CRC具有独特的基因组突变特征,可将其与其他类型CRC区分开 (图1C–H)。
3. 通路分析
作者团队分析发现,2条致癌信号通路(Hippo和RTK-RAS信号通路)在SA-CRC和S-CRC间有所不同。此外KEGG分析显示,7条仅在SA-CRC富集的信号通路中,Kaposi肉瘤相关的疱疹病毒感染通路可能与膀胱癌的发病机理有关。作者团队还鉴定出与 SA-CRC 预后相关的4个基因(HMCN1, MAGEC1, PCDHGA10 和SLITRK1),它们与SA-CRC病人的总体生存率和无复发生存率密切相关。而这些基因在S-CRC中未显示出此类相关性,强调了其与SA-CRC的独特关联 (图1I、J)。
总之,这项研究通过与其他结肠癌类型进行对比,揭示了 SA-CRC的独特基因组特征。尽管存在某些局限性,如仅使用WES数据进行分析和相对较小的样本量,这项研究首次揭示了SA-CRC的独特分子特征,促进了我们对其病因的理解,并为这种较少为人了解的癌症的治疗提供了启示。
文章来源
免费全文下载链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304222001611
引用这篇文章:
Yu D, Wang A, Zhang J, Li X, Jiang C, Zhou H. Genomic analysis of schistosomiasis-associated colorectal cancer reveals a unique mutational landscape and therapeutic implications. Genes Dis. 2023;10(3):657-659.
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