PLOS ONE:非小细胞肺腺癌生存期的不利独立预后指标
2018-05-12 海北 MedSci原创
来自宜宾市第一人民医院的研究人员通过使用癌症基因组图谱(TCGA)- 肺腺癌(LUAD)中的数据进行了回顾性研究,探讨了S100A16在总生存期(OS)和无复发生存期(RFS)方面的独立预后价值。
S100A16是哺乳动物中S100蛋白家族的保守成员。其在许多肿瘤中被观察到有所上调,且与恶性转化有关。
在这项研究中,来自宜宾市第一人民医院的研究人员通过使用癌症基因组图谱(TCGA)- 肺腺癌(LUAD)中的数据进行了回顾性研究,探讨了S100A16在总生存期(OS)和无复发生存期(RFS)方面的独立预后价值。此外,通过在TCGA-LUAD中使用深度测序数据,研究人员还探索了S100A16表达与其DNA甲基化和拷贝数改变(CNA)之间的关联。
结果显示,与正常肺组织(N = 59)相比,初级LUAD组织(N = 514)具有显着升高的S100A16表达。根据502例原发性LUAD病例的OS数据,研究人员发现高S100A16表达与较差的OS相关。单变量和多变量分析也证实,S100A16的表达增加是不利OS(HR:1.197,95%CI:1.050-1.364,p = 0.007)和RFS(HR:1.206,95%CI:1.045-1.393 ,p = 0.011)的独立预后指标。
通过检测TCGA-LUAD中的DNA甲基化数据,研究人员发现一些S100A16 DNA CpG位点通常在正常组织中超甲基化,但在LUAD组织中不存在。回归分析发现S100A16表达与其DNA甲基化之间呈中度负相关。
相比之下,尽管在LUAD患者中DNA扩增(+ 1 / + 2)频繁(378/511,74%),但与S100A16表达增加无关。
基于上述发现,研究人员推断,异常的S100A16表达可能受其DNA低甲基化调节,并能够作为LUAD中不利OS和RFS的独立预后指标。
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