Clinica Chimica Acta：lncRNA可作2型糖尿病患者为诊断标志物？
2020-02-06 MedSci MedSci原创
为了筛选与葡萄糖激酶调节蛋白基因(GCKR)相关的长链非编码RNA (lncRNA)，我们分析了在2型糖尿病(T2DM)患者和对照组中的差异表达。并验证lncRNA与GCKR的相关性，评估其作为T2DM分子标志物的潜在价值。
为了筛选与葡萄糖激酶调节蛋白基因(GCKR)相关的长链非编码RNA (lncRNA)，我们分析了在2型糖尿病(T2DM)患者和对照组中的差异表达。并验证lncRNA与GCKR的相关性，评估其作为T2DM分子标志物的潜在价值。
研究人员提取5例T2DM患者和5例非T2DM患者的淋巴细胞RNA，并通过芯片获得循环lncRNA和mRNA的表达谱。同时，选取127例T2DM患者和130例非T2DM患者，通过生物信息学分析筛选与GCKR基因相关的lncRNA。通过real-time
PCR检测两组患者GCKR基因和lncRNA
(ENST00000588707.1和TCONS_00004187)的表达水平，并进行相关分析。通过受试者工作特征曲线分析，循环ENST00000588707.1和TCONS_00004187作为诊断T2DM的生物标记物的值。
我们从表达谱中鉴定出68个lncRNA和74个mRNA差异表达。 与对照组相比，T2DM组GCKR基因，lncRNA
ENST00000588707.1和TCONS_00004187的表达水平明显降低（P <0.05）。 相关分析表明，ENST00000588707.1和TCONS_00004187与GCKR基因表达和糖脂代谢相关（P <0.05）。 ROC分析显示，T2DM患者和非T2DM患者之间的ENST00000588707.1曲线下面积为0.816（95％CI：0.764-0.869，敏感性72.0％，特异性80.3％），TCONS_00004187的AUC值为0.826（ 95％CI：0.774-0.879，敏感性81.6％，特异性61.3％）。
研究结果显示，lncRNA ENST0000588707.1和TCONS_00004187可作为T2DM的潜在生物标志物，通过调控GCKR基因参与糖脂代谢。
原始出处：
Qi Ma，Li Wang，Association between lncRNA and GCKR gene
in type 2 diabetes mellitus
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