ASCO2017：DNA去甲基化途径的遗传变异与乳腺癌风险之间的关系
2017-06-07 MedSci MedSci原创
由于TET1，TET2，TET3和TDG中的突变，DNA甲基化/去甲基化循环的不平衡与乳腺癌的发病和进展有一定关系。然而，目前很少有研究评估TET相关DNA去甲基化途径的遗传变异与乳腺癌风险之间的关系，特别是在非洲祖先妇女群体上。
由于TET1，TET2，TET3和TDG中的突变，DNA甲基化/去甲基化循环的不平衡与乳腺癌的发病和进展有一定关系。然而，目前很少有研究评估TET相关DNA去甲基化途径的遗传变异与乳腺癌风险之间的关系，特别是在非洲祖先妇女群体上。
研究人员调查了4个TET相关DNA去甲基化途径基因中的4095个单核苷酸多态性（SNP），其中包括非洲血统妇女，包含1657例[403雌激素受体阳性（ER +）和374
ER阴性（ER-）]和2029对照。使用与高度相关性（r 2 <0.8）的925个SNP的自适应级别截断产物（ARTP）检验进行甲基化途径和基因水平分析，并使用Logistic回归进行SNP级分析，用于估计优势比（OR）和95％置信区间（CI）。
结果显示 TET相关DNA去甲基化途径与ER阴性乳腺癌显著相关（P = 0.049）。基因水平分析显示，TET1是导致通路水平关联的候选基因（P = 0.008）。SNP TET1 rs10998376（OR = 1.21,95％CI = 1.02-1.42，P adj = 0.0032）即使在多重比较的基因水平校正后也具有统计学意义，并且与风险增的相关。在Boferroni矫正后，ARTP检测中P
> 0.05的基因SNP 均无显著性差异。
结论表明，特定的TET相关DNA去甲基化途径基因可能促进了乳腺癌的风险，特别是对非洲血统妇女的ER阴性肿瘤的风险。
原始出处：
Kris M. Lee, Shengfeng Wang, Dezheng Huo,. et.al. Association
of breast cancer risk in women of African ancestry with genetic variants in the
TET-related DNA demethylation pathway. ASCO2017
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