Genome Biology：英开发IntClust系统改善乳腺癌治疗

最近，英国科学家们开发出一种新的工具，可以将乳腺癌分为十种不同的亚型，有望改善这种疾病的治疗效果。相关研究结果发表在2014年8月28日的Genome Biology杂志。

癌症的发生，是因为遗传变化使正常细胞发展为肿瘤。随着对乳腺癌了解的增多，我们知道，这不是一种单一的疾病——引起不同类型癌症的基因突变是不一样的，这就是为什么肿瘤对治疗的反应有差异，为什么它们会以不同的速度生长。目前，临床医生预测治疗疗效有两个关键的指标。

发现肿瘤遗传学的研究动态，并创建一种系统来诊断肿瘤类型，是癌症科学家们的一个主要目标。为此，英国癌症研究所和剑桥大学的研究人员，开发了IntClust系统，该系统利用基因组技术来创建一种分类系统，该分类系统具有足够的细节，能够更准确地指出患者得的是哪种类型的乳腺癌，从而确定哪种治疗方法将是最合适的。

为了检测这个系统，科学家们分析了他们开发系统所用的997份肿瘤样本，以及来自公共数据库的7544份样本，连同基因组和临床数据，包括来自The Cancer Genome Atlas的数据。他们使用IntClust系统和今天使用的两个主要系统：PAM50，其将癌症分成五种类型；和SCMGENE，其将癌症分成4种类型，对这些数据进行分类。

他们发现，至少在预测患者预后和治疗疗效方面，IntClust与现有的系统无异。但是这个系统只在3.1%具有较差存活率的女性当中，识别出一个以前没有注意到的子群，这些患者似乎对治疗具有抵抗性。识别这一患者组的基因组标签，就能够在早期标记这些高风险的癌症，获得这一组患者的基因组数据，就可能有助于研究新的方法，治疗这种类型的癌症。

目前，利用该系统对肿瘤进行分类，对于大多数临床医生还是昂贵的，并且，解释这些结果也需要许多临床设置达不到的训练。但是，这一系统的细节和精度，可能对乳腺癌研究人员具有广泛的用处，它们将能够调查某类癌症对某些治疗方法反应较好的原因，以便寻找乳腺癌的临床标记，或发现其新的治疗靶点。

原始出处：

Ali H, Rueda OM, Chin SF, Curtis C, Dunning MJ, Aparicio S, Caldas C.Genome-driven integrated classification of breast cancer validated in over 7,500 samples.Genome Biol. 2014 Aug 28;15(8):431. [Epub ahead of print]