Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立基于第三代测序数据的二倍体组装算法
基于第三代测序数据,提出了二倍体的单倍型组装新算法,并开发了相应的软件PECAT。
测序中国 - 测序,二倍体组装算法 - 2024-04-10
关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!
一、导读:在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代基因测序的发展历史、原理、优劣势,以及国内外布局的公司等(也就是说,这是篇三代测序“科普文”)。此外,我们对
生物谷 - 基因测序,转化医学 - 2016-06-21
NEC OncoImmunity发布用于发现新HLA等位基因和肿瘤特异性HLA变体的独特HLA分型技术
该文献描述了一种进行新HLA等位基因分型和肿瘤HLA表征的新方法,用于指导个性化癌症免疫治疗。
网络 - HLA,肿瘤特异性HLA变体 - 2022-02-18
Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立甲基化检测新算法,可利用HiFi测序准确检测基因组单倍型5mC
基于PacBio HiFi测序技术,提出了可准确检测全基因组单倍型5mC的方法和流程,并开发了相应的软件ccsmeth和ccsmethphase。
测序中国 - 甲基化检测,HiFi测序,基因组单倍型5mC - 2023-07-19
【BioWeek资讯回顾】柳叶刀公布35国公民预期寿命,10大重磅药物面临专利过期,肥胖可能是种传染病……
为了帮助读者更好、更深入地了解前沿生物技术研究和生物行业内的成功商业模式。生物探索推出BioWeek栏目。通过综述生物圈内的产业动态和研究前沿,来帮助您更好地认识生物业内的“生态圈”。
生物探索 - 柳叶刀,药物,寿命 - 2017-02-27
Nat Commun:席瑞斌/苗素生团队开发长读长转录组数据的分析工具包TAGET
研究团队提出了一个名为TAGET的综合性计算工具包,用来分析Iso-seq全长转录组数据,包括转录本的映射和注释、基因融合的检测、差异表达分析以及差异同源异构体使用(DIU)分析。
测序中国 - 长读长转录组数据,TAGET - 2023-11-05
ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
激光荧光推动测序技术发展
DNA测序,无论从何种角度而言,都着实代表了生物检测最具活力的领域。尽管已历经25年发展,测序技术却没有合并为某种单一基本方法,而是发展出日益丰富的多样化技术(请参阅第 26页"表达谱和综合测序")。然而,激光激发的荧光技术依然是最为流行的检测方法。事实上,激光荧光技术在基因测序的发展中担任着关键的角色,测序环境的飞速变化也正在推动重要的产品趋势。 从Sanger法说起 首个成功测定一段
生物谷 - DNA测序,激光荧光 - 2015-06-23
Nat Commun:王建新教授团队建立基于簇分解和异常检测算法的罕见细胞识别方法
基于单细胞转录组测序数据,提出了准确的罕见细胞识别算法,并开发了相应的软件scCAD。
测序中国 - 单细胞转录组测序,罕见细胞 - 2024-09-04
Nat Commun:上海交大发布中国人胃癌泛基因组学分析
该研究首次将全新的泛基因组研究方法用于人类肿瘤基因组研究。通过构建胃癌人群泛基因组,再以泛基因组作为参照将每一例全基因组测序数据予以比对。
“生物世界”公众号 - 胃癌,泛基因组学 - 2022-09-27
振奋人心!深圳团队利用ctDNA检测肺癌,总检出率达91%,癌症变为不死慢性病终将实现!
近日,《美国经济学人》杂志报道,癌种早期筛查非常重要,尤其是男性高发前列腺癌和女性乳腺癌,如果采用早期筛查手段,患者生存率是100%,癌症将完全变成可控的慢性病,谈癌色变的情况也将不复存在。
贝壳社 - ctNDA,肺癌,检出率 - 2017-09-27
Nature Methods:中国学者发表论文,介绍三代测序数据计算方法的突破
9月18日,中山大学中山眼科中心谢志、肖传乐、谢尚潜,中山大学数据科学与计算机学院陈颖,湖南农业大学罗峰等学者合作在Nature Methods杂志上发表了三代基因组测序数据计算方法(https://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.4432.html),此方法解决了该领域的关键技术难题。
Nature自然科研 - 中国学者,Nature,Methods,三代测序数据计算方法,突破 - 2017-09-20
Nat Methods十周年特刊:十大革命性生物学技术盘点
二代测序、CRISPR、单分子技术、细胞重编程、光遗传学、超高分辨率显微镜等纷纷上榜。 二代测序 二代测序或大规模并行测序的出现,几乎影响了生物学领域的每一个角落。这一技术允许科学家们测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控、探索微观生命,将各种分析和筛选轻
MedSci原创 - 技术 - 2014-10-04
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