【论著】| 利用单细胞测序和转录组测序建立结直肠癌免疫细胞的9基因预后模型
我们基于CRC肿瘤微环境中免疫细胞的异质性构建了一个包含9个基因的风险预后模型,并据此预测了CRC患者的生存和治疗效果。
中国癌症杂志 - 结直肠癌,药物筛选,预后模型,scRNA-Seq,肿瘤免疫与免疫治疗 - 2024-07-13
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角。
生物探索 - 单细胞转录组测序,转录组年龄指数 - 2023-05-16
Protein & Cell:王永成/樊龙江团队合作开发微生物组单细胞转录组测序技术
该研究建立了基于随机引物的高通量单细胞RNA测序技术及其数据分析方法,首次实现了复杂微生物组样本的高通量单细胞转录组测序与分析。
测序中国 - 微生物组,单细胞转录组测序 - 2024-06-01
Circulation:单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征
内皮细胞(EC)根据其所处的血管和组织表现出相当大的功能异质性。虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
MedSci原创 - 内皮细胞,转录组,单细胞RNA测序 - 2020-09-19
SCIENCE:单细胞转录组揭示人肾肿瘤的细胞身份
信使RNA编码细胞功能和表型。在人类癌症的背景下,它定义了恶性细胞的身份和肿瘤组织的多样性。
MedSci原创 - 肾脏,肿瘤,单细胞测序 - 2018-08-12
单细胞转录组测序揭示原因并找到干预靶点
衰老相关的头发变白与黑色素细胞和黑色素细胞干细胞(MeSC)的耗竭有关,这可能受到头皮微环境中氧化应激和神经内分泌信号等因素的影响。
“生物世界”公众号 - 单细胞转录组,头发颜色 - 2022-05-28
单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展
与小细胞肺癌相比,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)更为常见[2]。
中国胸心血管外科临床杂志 - 单细胞转录组,非小细胞肺癌,免疫微环境 - 2024-03-17
CLIN CHEM:在自动平台上同步进行单细胞RNA和靶向DNA测序用于基因组和转录组的测量
MedSci原创 - 病理学,检验 - 2019-02-07
Blood:单细胞测序揭示驱动HSC体外生成的转录因子和分子通路
一直以来,造血干细胞体外扩增都是一个难以克服的挑战,Fidanza等通过单细胞测序发现了参与HSC体外生成的转录因子和分子通路,是否有助于解决HSC体外难以有效扩增的困境?
MedSci原创 - 单细胞RNA测序,造血干细胞和祖细胞,单细胞蛋白质表达分析 - 2020-07-14
Nat Methods:谢晓亮课题组开发单细胞联合三维基因组和转录组测序技术解析嗅觉受体选择机制
该工作为理解嗅觉受体增强子与嗅觉受体基因的空间互作如何动态协调“一个神经元,一个受体”选择过程提供了宝贵见解。
测序中国 - 嗅觉受体,三维基因组 - 2024-04-23
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03
MALBAC单细胞全基因组测序详细解析
单细胞全基因组测序一直是生物学家梦想得到的结果。但是其中必须解决的矛盾:1. 线性扩增。如果用全基因组PCR扩增,因为PCR的扩增偏向性(bias),再加上PCR过程中较小的偏向性通过指数放大,其结果就会是严重的覆盖不均一,导致在许多地方只有很低的覆盖、甚至没有覆盖。全基因组覆盖。常规的建库方法,因为补平、加A、接头连接效率的问题,
陈巍学基因 - 单细胞测序,全基因组 - 2014-04-06
Cell:单细胞全基因组高精彩度测序技术
日前,《细胞》(Cell)杂志上分别报道了来自中国学者的两项最新研究成果。复旦大学的徐彦辉等人首次破解 TET2 -DNA复合物的晶体结构;而来自北京大学的乔杰、汤富酬和谢晓亮等人则发布了突破性单细胞基因组检测技术。
生物360 - Cell,单细胞,全基因组,测序 - 2013-12-25
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