PNAS:庄小威发表新方法助力单细胞RNA分析
系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位,有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交(smFISH)是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间
生物通 - 庄小威,单细胞RNA分析 - 2016-11-25
NEUROPATHOLOGY AND APPLIED NEUROBIOLOGY:高通量单细胞RNA表达分析方法识别人类周细胞标记
根据单细胞RNA-seq分析、免疫菌块和免疫组织化学研究的综合结果,SLC6A12抗体非常适合标记人类FFPE脑切片中的周细胞。
MedSci原创 - 周细胞,高通量单细胞RNA表达分析 - 2023-10-21
Circulation:单细胞RNA分析揭示主动脉瘤组织的动态细胞变化和差异表达基因
升主动脉瘤(ATAA)是由主动脉壁逐渐减弱和扩张引起的,并可能导致主动脉夹层、破裂和其他危及生命的并发症。为了提高我们对ATAA发病机制的了解,Yanming Li等人开展了一项研究,旨在全面表征升主
MedSci原创 - 单细胞RNA测序,升主动脉瘤(ATAA) - 2020-10-15
Cell:将CRISPR和单细胞RNA测序结合在一起分析基因功能
哪些突变组合有助癌细胞存活?大脑中哪些细胞参与阿尔茨海默病发生?免疫细胞如何执行它们的复杂决策过程?如今,在一项新的研究中,来自以色列魏兹曼科学研究所等机构的研究人员在一种方法中将两种强大的研究工具--- CRISPR基因编辑和单细胞基因组分析---结合在一起,从而可能最终有助我们解答这些问题和更多的其他问题
生物谷 - CRISPR - 2016-12-18
Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析揭示了人类骨关节炎的进展
这项研究结果为软骨细胞分类学提供了新的见解,并为人类OA软骨再生的有效和功能性操作提供了潜在线索。
MedSci原创 - 骨关节炎,RNA-seq分析,软骨细胞,HTCs - 2018-07-24
Cell:单细胞RNA测序为果蝇神经元分类
大脑的神经系统由成千上万种不同类型的神经细胞构成,这些神经细胞在细胞形态,突触连结及生理功能上具有高度的多样性。不同种类的神经细胞中,其基因组、蛋白组、化学分子组成、代谢也都有着很大的差别。因此,对脑内神经细胞进行分类,以更好地理解其分子特性及生理功能十分重要。
生物探索 - RNA测序,脑神经,神经元 - 2017-11-17
ReactomeGSA:高效的单细胞通路分析工具
Pathway analyses是组学实验分析的关键方法。然而,整合来自不同组学技术和不同物种的数据仍然需要大量的生物信息学知识。在单细胞数据科学中,Pathway analyses也是基因表达数据链
简书 - 单细胞 - 2021-02-06
Nature Methods:便携、低成本的单细胞RNA测序新手段
每个细胞的基因表达谱随其功能而异。从血液或组织样本中的许多单个细胞中提取RNA可以根据基因表达模式区分细胞。这使科学家有机会确定细胞功能,包括它们在疾病中的作用或对治疗的反应。MIT的研究人员已经开发出一种便携式技术,可以快速制备多种细胞的RNA同时进行测序,他们相信这种方法将会更广泛地被应用。新的技术被称为Seq-Well,可以让科学家在组织样本中更容易识别不同类型的细胞,帮助他们研究免疫细胞如
生物探索 - 单细胞,RNA,测序 - 2017-02-20
Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析可以识别半月板祖细胞并揭示半月板变性的进展
识别半月板祖细胞为基于细胞的半月板组织工程学提供了全新的角度,并证明了半月板变性的新机制,而这有助于开发新的治疗策略。
MedSci原创 - 半月板变性,单细胞RNA-seq分析,半月板祖细胞,DegP - 2020-01-07
CELL:人类脑部恶性肿瘤单细胞分析
组织驻留和入侵的免疫细胞在TME内的异质性允许我们明确区分胶质瘤和脑转移瘤(BrM)。胶质瘤TME主要是以组织驻留、反应性小胶质细胞为主,而组织侵入性白细胞主要积累在脑转移瘤中。
MedSci原创 - 胶质瘤,免疫细胞,脑肿瘤,脑转移瘤 - 2020-05-30
Circulation:单细胞RNA测序揭示器官特异性内皮细胞的不同特征
内皮细胞(EC)根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
MedSci原创 - 内皮细胞,单细胞RNA测序,Lars2基因 - 2020-11-11
Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制,这将丰富AS单细胞研究的数据,为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎,整合单细胞RNA-SEQ,ATAC-SEQ - 2022-02-19
Circulation:单细胞RNA测序揭示心肌纤维化和肥大的驱动细胞
但是,尚不清楚驱动心脏纤维化的特定细胞和分子以及不同细胞群体对心脏纤维化的相对影响。
MedSci原创 - 2020-10-16
单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法
TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法,可以把少量RNA(最少到1个细胞,约10pg)扩增到ng级,以达到可以进行高通量测序所需的核酸量cDNA:RNA杂交产物中的RNA被RNase
陈巍学基因 - 单细胞测序,SMART - 2014-04-06
庄小威PNAS发表研究新成果:新方法助力单细胞RNA分析
本文转载自生物通,原标题“著名学者庄小威发表研究新成果 新方法助力单细胞RNA分析”。系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位,有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交(smFISH)是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间定位的有力武器。
生物通 - 单细胞RNA - 2016-11-26
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