Cancer Cell：抗癌新视角——非编码基因变“废”为宝
导语：在真核生物的基因组中，虽然非编码DNA占了绝大多数，但由于不编码蛋白质，它们常被视为无用的基因组片段，甚至被称为“垃圾DNA”。然而，随着基因组研究的不断深入，科学家发现这些看似无用的基因组区域，可能有着独特且重要的生物学功能。
转化医学网 - 抗癌，非编码基因 - 2019-11-22
Oncogene：鉴定出非编码RNA调控的新促癌基因
胃癌是我国发病率和死亡率排名前三的恶性肿瘤，最新一项研究发现了胃癌中一个新的促癌基因KIAA1199，并对其促癌作用、下游信号通路和表达调控机制进行了深入研究，为胃癌的分子治疗提供了新的靶点。
生物通 - 胃癌，KIAA1199，PTP4A3 - 2019-01-17
如何利用基因魔剪—CRISPR技术来进行非编码基因组功能的研究？
我们或许才刚刚开始打开对巨大的基因组非编码区域的研究，基于CRISPR的两项新技术或许就能够帮我们开启研究的新篇章。我们(原文笔者)能够很好地理解基因组中编码蛋白组分背后的规则，同时通过对DNA序列的观察我们也能够找出从事编码作用的基因的开始以及终止位置。对于基因组中残留的98%的基因组而言，却又是一番不同的故事了，如今我们对于DNA暗物质的理解都是来自于对非编码DNA单个
生物谷 - Crispr技术 - 2016-10-23
我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式
于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cells”（反义长链非编码RNA调控基因表达和多能干细胞分化），系统揭示了长链非编码RNA顺式调控基因
生物谷 - 基因治疗 - 2016-03-24
Science：对癌症中体细胞非编码突变模式的全基因组分析
这些研究结果表明非编码突变与一系列不同的生物过程有关，它们在基因组中的位置对于准确解释它们至关重要。
生物谷 - 癌症，全基因组 - 2022-04-13
Nucleic Acids Res：长非编码RNA在节律基因调控方面的研究成果
2017年3月8日，国际核酸类重要学术期刊《Nucleic Acids Research》杂志在线发表了中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、中科院神经科学研究所严军研究组题为“A class of circadian long non-coding RNAs mark enhancers modulating long-range circadian gene regulation”的论文。研
生物帮 - 基因调控，神经所，非编码RNA - 2017-04-14
Nat Genet：转移性乳腺癌中雌激素受体编码基因或变异
据《自然—遗传学》上的两项独立研究显示，在某些转移性乳腺癌病例中，负责编码雌激素受体的基因会发生变异。这意味着雌激素受体对抗药物或对某些转移性乳腺癌病例具有疗效。Sarat Chandarlapaty等人选取了36个对激素疗法产生抗性的转移性乳腺癌肿瘤，对其中的230种基因进行测序，在9个肿瘤中发现ESR1基因突变。他们分析了44个转移性乳腺癌肿瘤中的ESR1基因，发现其中5个肿瘤存在基因突变
中国科学报 - 肿瘤，癌症 - 2014-01-02
Blood：PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构
中心点：PU.1编码基因的空间染色质结构，在髓系分化过程中动态重构，在AML中被破坏。PU.1自动调节启动空间重构，并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。摘要：基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内，但大多数基因的精确的空间要求尚未明确；该点对与癌症相关的基因特别有意义。
MedSci原创 - PU.1，三维结构，拓扑关联域，LDB1 - 2018-10-14
Nat Med：“基因酮的DNA编码中的突变”可有效抵抗肺癌及其它癌症
根据纽约大学一项研究表明，有助于肺癌发展的基因突变也使其易受一种有希望的实验性药物的影响。该研究发表在10月2日的自然医学杂志上。
medicalxpress - 基因酮，癌症，有效 - 2017-10-03
谁说所谓的非编码性RNA就一定没有编码性？
2002年，来自德国马克斯普朗克植物育种研究所的研究豆科植物的研究人员发现一种之前被认为发挥着非编码功能的长679个核苷酸（679nt）的RNA实际上是一种编码蛋白的信使RNA（mRNA）[1]。基于它的长度大于200nt，它被归类于长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）。这种RNA是由被称作早期结瘤素40（early nodulin 40, ENOD40）
生物谷 - 非编码性RNA - 2016-06-26
Nat Genet | 发现8个新基因！外显子组测序揭示罕见编码基因突变对成人认知功能的影响
成人的认知功能受到罕见蛋白质编码基因突变的显著影响，并鉴定了与成人认知表型相关的八个基因（ADGRB2、KDM5B、GIGYF1、ANKRD12、SLC8A1、RC3H2、CACNA1A和BCAS3）
测序中国 - 认知功能 - 2023-07-17
Nat Genet：利用饱和基因组编辑分析抑癌基因BAP1编码序列中99%的所有可能SNV
研究团队分析了18,108个独特变异，其中6,196个被发现具有异常功能，并使用这些数据评估了UK Biobank中的表型关联。
测序中国 - BAP1，SNV，BRCA1相关蛋白1基因 - 2024-08-04
Cancer Cell：隐藏在非编码DNA中的卵巢癌基因
科学家们一直致力于在基因组中寻找与癌症有关的遗传学改变。在此基础上，人们对癌症的理解以及癌症治疗都取得了巨大的进展。这类研究大多关注基因组的编码区域，但这一区域只占到人类DNA的2%，应该还有大量癌症相关突变发生在非编码DNA上。非编码DNA曾被称为“垃圾DNA”，虽然人们早已知道它们其实并不是垃圾（许多转录为RNA），但解析这些序列的功能并不容易。 日前，宾夕法尼亚大学
生物通 - 卵巢癌，垃圾DNA，非编码DNA - 2014-09-15
Sci Rep：自闭症可能与mGluR5编码基因有关
然而,双胞胎研究证明ASD具有遗传性,引发研究人员寻找相关基因。 费城儿童医院的Hakon Hakonarson博士和同事开始着
MedSci原创 - 自闭症，22q11.2删除相关综合症，RANBP1 - 2016-01-22
Science：张峰等人发现CRISPR在非编码基因组中的应用
两个独立的研究小组分别证明了基于 CRISPR 的技术可以用于识别疾病相关基因的关键调控元件 来自麻省理工学院，Broad研究院等处的研究人员利用一个大型单导向RNA（sgRNA）文库，发现了影响癌症患者耐药性的基因的非编码调控元件，这一重要的发现公布在9月29日的Science杂志上，同期杂志的另外一项独立研究采用了一种高通量 CRISPRi 筛选技术，也在距离两种疾病相关基因1Mb（兆
MedSci原创 - 张峰，CRISPR - 2016-10-03
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