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SPATA:<font color="red">基因</font>集驱动的空间<font color="red">转录</font>组分析框架

SPATA:基因集驱动的空间转录组分析框架

SPATA -

简书 - 生物信息学,空间转录组 - 2021-02-06

Blood:晚期皮肤T细胞淋巴瘤STAT-6调控<font color="red">基因</font>的全<font color="red">基因</font><font color="red">转录</font>组分析

Blood:晚期皮肤T细胞淋巴瘤STAT-6调控基因的全基因转录组分析

STAT-6是MF/SS肿瘤发生的主要因素,是一个有前景的治疗干预靶点。 STAT-6促进MF/SS恶性淋巴细胞的增殖和侵袭,同时逐步抑制抗肿瘤免疫反应。

MedSci原创 - 蕈样肉芽肿,Sezary综合征,STAT-6 - 2020-05-23

Nature:揭示<font color="red">转录</font>因子位置依赖性:解密<font color="red">基因</font>调控的空间密码

Nature:揭示转录因子位置依赖性:解密基因调控的空间密码

该研究揭示了如何通过结合位点的空间配置来解码基因组中的调控信息,这对于理解基因调控和非编码DNA突变如何导致疾病有重要意义。

生物探索 - 转录因子,基因调控 - 2024-07-23

Cell reports:<font color="red">转录</font>激活因子抑制<font color="red">基因</font>表达——一切皆有可能

Cell reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能

近日,来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展,他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ,也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性  YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下游的具有癌基因功能的转录共激活因子,在正常的上皮细胞中过表达YAP/TAZ能够诱导细胞发

生物谷 - 转录因子,基因表达 - 2015-04-10

AGING CELL:长寿<font color="red">基因</font>可稳定衰老<font color="red">转录</font>组,并应对内部应激

AGING CELL:长寿基因可稳定衰老转录组,并应对内部应激

至今为止,我们关于衰老过程中转录组变化的作用和调节机制尚不清楚。研究人员已经提出,由于转录因子与年龄相关的下调,转录组在衰老期间遭受衰退。

MedSci原创 - 衰老,稳态 - 2019-02-18

Cell丨专家解读“<font color="red">转录</font>延伸如何影响三维<font color="red">基因</font>组结构”

Cell丨专家解读“转录延伸如何影响三维基因组结构”

真核生物的DNA复制、DNA损伤修复、基因转录等重要生物功能都在细胞核的三维空间中完成,基因组的三维结构对这些生物功能有显着的影响。目前研究基因组三维结构的高通量方法包括Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture)和ChIA-PET (Chromatin Interaction

BioArt - 专家解读,转录延伸,三维基因组结构 - 2018-08-30

Genome Biol:HSV-1感染期间广泛激活宿主<font color="red">基因</font>组的反义<font color="red">转录</font>

Genome Biol:HSV-1感染期间广泛激活宿主基因组的反义转录

疱疹病毒已经进化出多种方式来使受感染的细胞适应它们的需要,但关于HSV-1转录转录后修饰的了解知之甚少。本研究中,研究人员发现,HSV-1诱导来自人宿主细胞基因组的约1000个反义转录物的表达。反义转录物起源于基因启动子或基因体内,并且表

MedSci原创 - HSV-1,反义转录 - 2017-11-03

单细胞<font color="red">转录</font>组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”<font color="red">基因</font>的表达模式

单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角。

生物探索 - 单细胞转录组测序,转录组年龄指数 - 2023-05-16

Science:利用空间<font color="red">转录</font>组学技术可视化观察组织中的<font color="red">基因</font>表达

Science:利用空间转录组学技术可视化观察组织中的基因表达

在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial transcriptomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的

生物谷 Bioon.co - 转化医学,转录,RNA - 2016-07-04

Nat Commun:<font color="red">基因</font>组和<font color="red">转录</font>组分析为对抗致命感染找到新希望

Nat Commun:基因组和转录组分析为对抗致命感染找到新希望

最近一项发表在国际学术期刊Nature Communication上的文章为毛霉目真菌的进化过程提出了新的见解。毛霉目真菌这是一类能够引起致命感染的真菌,这种感染在部分病人群体中越来越多,该研究发现的一些分子途径或可在将来开发为潜在的治疗和诊断靶点。当人类的免疫系统功能减弱,毛霉目真菌就容易侵入人类细胞,引起致命感染——毛霉菌病。马里兰大学医学院等机构的研究人员经过研究发现了病人发生毛霉菌病的过程

生物谷 - 基因组,转录组 - 2016-07-25

Epigenetics Chromatin:巨噬细胞活化期间<font color="red">转录</font>增强子的全<font color="red">基因</font>组谱分析

Epigenetics Chromatin:巨噬细胞活化期间转录增强子的全基因组谱分析

增强子已成为调控基因表达激活的关键DNA元件。通过对基因表达和表观遗传数据的分析,研究人员确定了骨髓源性巨噬细胞的大规模转录增强子,其时间动力学和靶蛋白编码基因。研究观察到靶基因表达的增加,伴随着相关增强子数量的增

MedSci原创 - 2017-11-03

PLoS ONE:<font color="red">转录</font>组断层技术可对脑部疾病的<font color="red">基因</font>表达进行三维成像

PLoS ONE:转录组断层技术可对脑部疾病的基因表达进行三维成像

近日,来自日本一个研究小组开发出了一种新型技术,可以对大脑结构中的基因表达样式进行三维成像,这种技术俗称为转录组断层技术,其结合了组织切片的微阵列技术,可以都对脑部基因表达的密度和位置进行精确图谱成像,

生物谷 - 研究 - 2013-01-14

SCI REP:人类ATP6V1A<font color="red">基因</font>在胃癌中的表达和<font color="red">转录</font>调控

SCI REP:人类ATP6V1A基因在胃癌中的表达和转录调控

由于人类ATP6V1A基因在GC中编码V-ATP的酶催化亚基A,因此,我们研究了人类ATP6V1A基因的表达和作用。

MedSci原创 - 胃癌,ATP6V1A,YY1 - 2017-06-07

Science:科学家阐明机体细胞糖酵解与<font color="red">基因</font><font color="red">转录</font>之间的神秘关联

Science:科学家阐明机体细胞糖酵解与基因转录之间的神秘关联

近日,一项刊登在国际著名杂志Science上的研究报告中,来自德克萨斯大学等机构的科学家们通过研究发现,在脂肪细胞分化期间,NAD+的合成和消耗或能整合葡萄糖代谢和基因转录过程;文章中,研究人员深入阐明了机体中的葡萄糖如何转化成为脂肪

细胞 - NAD+,肥胖,葡萄糖 - 2018-05-14

Epigenomics:变应性鼻炎-哮喘综合征中,<font color="red">基因</font>表达特性的<font color="red">转录</font>调控分析

Epigenomics:变应性鼻炎-哮喘综合征中,基因表达特性的转录调控分析

最近,有研究人员进行了旨在评估在变应性鼻炎和哮喘综合症(CARAS)中,基因表达特性的转录调控情况。研究包括了3名CARAS病人、3名过敏性鼻炎病人和3名正常对照参与者的血样。研究人员利用cuffdiff、miRDeep2和DEGseq分别来来定量基因和miRNAs的表达情况,并且p值小于0.01和错误发现率小于0.001时,认为基因或者miRNAs的表达具有显著的差异。

MedSci原创 - 鼻炎,哮喘,转录调控,基因表达 - 2018-01-25

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