Science:如何从宏基因组中挖掘未知酶
2月10日的Science上哈佛大学和MIT的研究人员合作发表的一篇文章显示结合基因组和生物化学知识可以揭示菌群中的未知酶途径。使用一个新的工作流程,他们发现了反式-4-羟基-L-脯氨酸(在人体蛋白和
生物探索 - 宏观基因组 - 2017-02-14
Nat Rev Microbiol:宏基因组关联分析与微生物组
我们体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。近年来人们发现这些微生物对人体健康有着重要的影响,微生物组研究因此受到了极大的重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。宏基因组关联分析(Metagenome-wide association studies,MWAS)是挖掘微生物组宝藏的有力工具,可以高分辨率研究微生物组与复杂疾病的关联,比如二型糖尿病、肥胖症、肝硬化
MedSci原创 - 宏基因组,关联分析,微生物组 - 2016-07-13
图解:宏基因组急危重症感染应用专家共识
近日,《中华急诊医学杂志》发表宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识。作为首篇mNGS临床应用的专家共识,其对宏基因组临床应用场景,研究进展,基本流程,挑战和未来发展方向做出详细概述。
微远基因 - 宏基因组,急危重症 - 2019-02-12
Nature子刊:深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒
人类微生物组的组成和功能与宿主的健康密切相关。除了细菌外,肠道微生物群中的非细菌成员(古菌、真菌和病毒)也在微生物群落的动态演替以及人类的生理、免疫、疾病等方面发挥着重要作用。
网络 - 肠道宏基因组,古菌病毒 - 2023-01-02
Science:建立人类微生物组化学库的宏基因组学策略
最近几年,研究人员已经在确定微生物组对人类生理和疾病的影响方面取得了显着进展,但是控制这些作用的潜在分子和机制在很大程度上尚待探索。
MedSci原创 - 微生物,宏基因组 - 2019-10-20
【协和医学杂志】宏基因组高通量测序技术的临床应用:现状、挑战与前景
本文将概述mNGS检测国内外临床应用现状,并对该领域未来发展所面临的挑战与前景进行论述。
协和医学杂志 - 宏基因组高通量测序 - 2023-10-08
Cell Rep:肠道微生物大规模宏基因组研究突破,助力治疗心血管疾病!
导语:肠道菌群是一个动态且高度多样化的微生物生态系统,会影响宿主生理的许多方面,虽然许多研究侧重于单个微生物分类群对机体健康的影响,但它们的整体代谢潜力尚未得到充分的探索。
MedSci原创 - 肠道微生物 - 2020-03-19
宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识
宏基因测序技术实验流程操作略显繁琐,分析流程复杂,检测结果冗长,因此对实验室操作人员及解读人员的素质要求颇高,对相关的质量控制也需要标准化。简述了该技术在医院获得性肺炎中的应用及关键环节的质量控制。
中国急救复苏与灾害医学杂志 - 医院获得性肺炎,宏基因组学测序技术 - 2023-06-08
Sci Rep:尿路感染微生物宏基因组分析
为了对尿路微生物群进行一定的认识,研究人员分析了临床实验室特点和121例无菌条件下获得的尿液样本的微生物宏基因组数据。研究人员成功的获得了116名参与者的16S rDNA基因特性,并且在来源于49名参与者的样本中成功生成了宏基因组测序数据。尽管16S rDNA测序数据更加敏感,宏基因组测序数据具有更加综合的和无偏差的微生物群结果特
MedSci原创 - 尿路感染,宏基因组,微生物 - 2018-03-22
宏基因组与代谢组学的惊人发现!
DOP在缓解由DSS诱导的UC小鼠模型症状方面展现出显著的潜力,并为开发预防和治疗UC的功能性食品提供了有力的科学依据。
MedSci原创 - 溃疡性结肠炎,铁皮石斛多糖 - 2024-09-12
高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识
宏基因组下一代测序(mNGS)技术直接针对标本中核酸无偏倚检测病原微生物序列。但是,mNGS需经标本前处理、核酸提取、文库制备、上机测序、数据库比对、报告生成及结果解读等一系列过程,对技术平台及人员素
中华检验医学杂志.2020.43(12):1181-1195. - 病原微生物 - 2021-01-31
Neurology:肠道微生物组宏基因组学分析提示,多发性硬化患者可能存在肠道微生物紊乱!
近日,研究人员利用儿童发病的MS患者和正常对照者的粪便样本进行宏基因组分析。研究发现,肠道微生物群的功能潜能和分类学在两组之间有所不同,包括古菌产甲烷途径的高发病率和乳酸发酵途径缺失。
MedSci原创 - 多发性硬化,肠道微生物菌群,神经变性病,疾病修饰治疗 - 2022-01-14
2023第六届世界帕金森大会:帕金森病-肠道宏基因组最新进展
这些数据集将展示肠道宏基因组失调的程度和驱动因素,该研究的可重复性和信息含量将促进PD治疗和预防相关研究。
MedSci原创 - 帕金森病,帕金森病进展 - 2023-07-07
STROBE-宏基因组学:指导宏基因组学研究报告的 STROBE 扩展声明
宏基因组学一词是指使用测序方法从样本中存在的所有生物体中同时识别基因组材料,其优势是比培养或其他方法具有更高的分类分辨率。应用包括病原体检测和发现、物种表征、抗菌素耐药性检测、毒力分析以及影响健康的微
Lancet Infect Dis . 2020 Oct;20(10):e251-e260. - STROBE,报告规范,宏基因组学 - 2021-09-01
从宏基因组测序推断的微生物组成数据的统计分析指南
从宏基因组测序推断的微生物组成数据的统计分析指南
Curr Issues Mol Biol . 2017;24:17-36 - 宏基因组,宏基因组学,宏基因组学测序 - 2021-10-21
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