Cell:利用蛋白质-基因组学描述人高分级浆液性卵巢癌
在一项新的研究中,来自美国西北太平洋国家实验室(PNNL)和约翰霍普金斯大学(JHU)等机构的研究人员研究了169名卵巢癌患者的肿瘤蛋白质组以便鉴定她们所患肿瘤中存在的关键性蛋白。通过将这些卵巢癌蛋白质组方面的发现与已知的这些肿瘤的基因组数据整合在一起,研究人员报道了对最为恶性的卵巢癌---浆液性卵巢癌(serous ovarian cancer)---的潜在新认识。
生物谷 - 蛋白质,蛋白质,卵巢癌 - 2016-07-03
PNAS:癌症和邻近正常组织中具有重复不稳定的蛋白质组学和基因组学特征
已有的研究显示,重复序列是多个层次的进化热点。然而,由于其装配和分析中涉及的困难,现今,我们关于重复序列在肿瘤进化中的作用还知之甚少。
MedSci原创 - 肿瘤,基因组 - 2019-08-09
BioNeMo模型扩展到基因组学!英伟达推出生成式AI药物设计和蛋白质预测项目
英伟达计划将扩展后的BioNeMo模型作为一系列基于云的企业服务提供给客户,并通过AWS HealthOmics平台提供药物分子结合和蛋白质结构变化的预测指标。
测序中国 - BioNeMo模型,基因组学,AI药物设计,英伟达 - 2024-03-27
基因组学的2016年:年度回顾
作者:Francis deSouza | 2016年12月29日2016年,基因组学在整个世界范围内引领我们朝着精准医疗的承诺更进了一步。这一年的成就不仅让人难以置信,也再次让我相信,我们才刚刚开始看到基因组学的影响。以下是我对这一年的看法。群体基因组学的腾飞为了更好地了解遗传学与疾病之间的关联,一个又一个国家开始欣然接受大规模的群体测序。根据这些国家级项目,数十万人将在未来几年中接受基因组测序。
生物探索 Illumina - 基因组学,2016年,年度回顾 - 2017-01-09
基因组学推进肿瘤研究未来发展
基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。 癌症通常按照形态进行分类,这指的是病理学家在显微镜下看到的内容。“如今,癌症分类依据已经开始从形态特征转变为更有效的治疗方式,其中的主要转变在很大程度上归功于基因组研究。”
中国科学报 - 癌症,筛查,基因组学 - 2016-06-28
Cell | 肾透明细胞癌的整合蛋白基因组学研究
为了揭示ccRCC发生的分子机制,TCGA对基因组、表观遗传组、转录组进行分析,鉴定出包括多种抑癌基因缺失在内的ccRCC分子特征。研究显示VHL基因异常是一个普遍性起始事件,随后PBRM1、SETD2、KDM5C、BAP1等突变参
BioArt - 肾透明细胞癌,的整合蛋白基因组学研究 - 2019-11-02
Genome Medicine:基于人血浆蛋白质组与基因组数据,鉴定新型CRC蛋白质标志物及药物靶点
研究团队对4,853种血浆蛋白与CRC风险之间的因果关联进行了全面研究;采用单细胞类型表达分析来检测结肠肿瘤组织中富集的细胞类型,并进行成药性评估,以探索其作为CRC治疗靶点的潜力。
测序中国 - 结直肠癌,CRC蛋白质标志物 - 2023-10-30
基于全基因组基因型-血清蛋白质组分析,首次揭示中国汉族人群血液蛋白质组的遗传机制
循环蛋白作为生物标志物被广泛用于揭示新的药物靶点和临床结果的解释。蛋白质的遗传调控众所周知,但却鲜有描述,这不仅激发了商业上的兴趣,也激发了科学上的探索。
测序中国 - 循环蛋白,蛋白质水平 - 2023-03-14
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
Nature:大规模乳腺癌“蛋白质基因组学”被揭示
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”(proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然》(Nature)杂志上的研究论文,证实了相比于单独采用任一种分析方法,整合基因组和蛋白质组数据来生成更完
MedSci原创 - 乳腺癌,蛋白质基因组学 - 2016-05-28
PNAS:特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”
近日,发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中,来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点,研究人员发现了一种新型特殊蛋白,其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性
生物谷 - 蛋白质,基因组 - 2014-12-09
STROBE-宏基因组学:指导宏基因组学研究报告的 STROBE 扩展声明
宏基因组学一词是指使用测序方法从样本中存在的所有生物体中同时识别基因组材料,其优势是比培养或其他方法具有更高的分类分辨率。应用包括病原体检测和发现、物种表征、抗菌素耐药性检测、毒力分析以及影响健康的微
Lancet Infect Dis . 2020 Oct;20(10):e251-e260. - STROBE,报告规范,宏基因组学 - 2021-09-01
基因组学何时可以治愈癌症?
日前,人类基因组计划的领导者之一、美国哈佛-麻省理工博德研究所(Broad Institute of MIT and Harvard)主任 Eric Lander 在接受美国《大西洋月刊》(The Atlantic)采访时,介绍了基因组学发展的未来和基于基因组学的疾病治疗方法的前景。他指出,人类基因组计划耗时 15 年和
手牵手博客站 - 癌症,Eric,Lander,基因组学 - 2014-01-15
基因组学技术进展(Genome Technology)
第一主题 基因组学技术进展 1. 测序新技术 2. 转录基因组学 3. 表观基因组学 4. 外显子组学 1.Genome Technology ?
会议 - 2009-03-11
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