Nucleic Acids Res:空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST
DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息(H&E染色图片)中提取图像特征,然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成,
测序中国 - 数据挖掘,算法,空间转录组学 - 2022-10-24
Front Endocrinol:利用转录组学数据诊断儿童和青少年生长激素缺乏症
基因表达(GE)数据在比较儿童生长激素缺乏症(GHD)儿童和正常儿童时,已经显示出作为一种新的工具来帮助诊断GHD的前景。本研究的目的是评估GE数据在儿童期和青春期GHD诊断中的效用。
MedSci原创 - 诊断,生长激素缺乏症,转录组学数据 - 2023-06-26
Acta Neuropathologica: 神经鞘瘤病的表观遗传学、基因组学和转录组学
神经鞘瘤病(SWNTS)是一种遗传性肿瘤易感综合征,是神经纤维瘤病的一种形式。
MedSci原创 - 神经鞘瘤病,LZTR1,基因组学 - 2020-10-13
Circulation:单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征
虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
MedSci原创 - 内皮细胞,转录组,单细胞RNA测序 - 2020-09-19
J Ethnopharmacol:代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制
该研究通过代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制。
MedSci原创 - 中医药,代谢组学,转录组学,慢性心肌缺血,瓜蒌薤白汤 - 2022-09-21
鲍慧铮教授:Burkitt淋巴瘤的整合基因组学和转录组学特征
Burkitt淋巴瘤(BL)是一种侵袭性B细胞非霍奇金淋巴瘤,其具有涉及MYC和免疫球蛋白增强子的标志性易位。BL常发生于儿童,有三种变异类型:地方性,散发性和HIV相关性。EB病毒相关的地方性亚型(eBL)在非洲赤道地区非常普遍,是那个地区是最常见的儿童恶性肿瘤。
ioncology - Burkitt淋巴瘤,整合基因组学,转录组学 - 2017-12-18
Chin Med:大鼠模型对补骨脂阴/阳相关差异反应的综合代谢组学和转录组学研究
探讨阳虚证和阴虚证模型对补骨脂(BGZ)的差异反应,并确定相应的特征生物标志物。
MedSci原创 - 肝损伤,代谢组学,转录组学,易感个体,补骨脂 - 2023-08-20
Nat Biotechnol发表新空间组学方法,同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析
研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性,并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。
测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03
右心室对急性压力后负荷增加的时空转录组学反应
利用降维来分析跨多个加载条件的整个时空空间。 这种方法使我们能够可视化 11 种相互比较的条件,并确定关键重塑通路的激活如何受到时间、机械应力和区域的影响。
MedSci原创 - 右心室,空转录组学,急性压力超负荷 - 2023-06-19
Nat Methods:基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较
研究团队选择了一系列具有明确定义的组织结构特征的组织作为参考,使用其生成数据比较了11种sST方法。
测序中国 - 单细胞转录组测序,空间转录组技术 - 2024-08-03
Nature:RNA 修饰研究有助表观转录组学进一步发展
随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘,帮助我们了解表观转录组学(epitranscriptomics)的工具也变得越来越多了。
生命奥秘/Eason - RNA修饰,转录组学 - 2017-03-21
Blood:慢性淋巴细胞白血病Richter转化的基因组和转录组学特征
慢性淋巴细胞白血病(CLL)向高级别B细胞淋巴瘤的转化被称为Richter综合征(RS),较为罕见,而且这类患者的预后较差。
MedSci原创 - 慢性淋巴细胞白血病(CLL),WGS,Richter转化 - 2020-12-25
Nat Genet:WES联合RNA-seq分析揭示晚期NSCLC免疫治疗的基因组学和转录组学特征
通过对基因组特征以及已有的免疫和肿瘤生物学相关特征的综合分析,发现了不同信号通路和不同细胞类型之间复杂相互作用的现象,进一步揭示了免疫检查点抑制剂治疗背后的多维度相互作用。
测序中国 - NSCLC免疫治疗 - 2023-05-06
国家基因组科学数据中心:整合中国组学资源,打破数据孤岛
用好科技资源 支撑创新发展2018年、2019年连续两年,组学数据库权威杂志《核酸研究》对前一年的全球基因组数据库建设进行总结,鲜见地在美英两个老牌的数据库以外,提到了中国的GSA(组学原始数据归档库)“美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,简称NCBI)和英国欧洲生物信息学中心(European Bioinform
科技日报 - 医学人文 - 2019-11-20
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